Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

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Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SirpaP97797 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SirpaP97797 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms