Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SirpaP97797 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SirpaP97797 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SirpaP97797 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SirpaP97797 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SirpaP97797 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms