Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gfra1P97785 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra1P97785 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms