Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NyxP83503 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NyxP83503 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NyxP83503 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NyxP83503 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NyxP83503 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NyxP83503 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NyxP83503 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NyxP83503 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NyxP83503 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NyxP83503 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NyxP83503 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NyxP83503 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NyxP83503 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NyxP83503 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NyxP83503 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NyxP83503 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NyxP83503 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NyxP83503 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NyxP83503 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NyxP83503 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NyxP83503 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NyxP83503 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NyxP83503 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NyxP83503 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NyxP83503 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NyxP83503 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NyxP83503 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NyxP83503 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NyxP83503 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NyxP83503 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NyxP83503 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NyxP83503 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NyxP83503 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NyxP83503 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NyxP83503 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NyxP83503 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NyxP83503 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NyxP83503 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NyxP83503 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NyxP83503 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NyxP83503 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NyxP83503 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NyxP83503 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NyxP83503 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NyxP83503 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NyxP83503 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NyxP83503 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NyxP83503 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NyxP83503 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NyxP83503 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NyxP83503 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NyxP83503 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NyxP83503 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NyxP83503 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NyxP83503 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NyxP83503 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NyxP83503 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NyxP83503 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NyxP83503 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NyxP83503 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NyxP83503 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NyxP83503 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NyxP83503 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NyxP83503 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NyxP83503 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NyxP83503 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NyxP83503 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NyxP83503 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NyxP83503 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NyxP83503 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NyxP83503 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NyxP83503 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NyxP83503 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NyxP83503 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NyxP83503 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NyxP83503 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NyxP83503 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NyxP83503 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NyxP83503 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NyxP83503 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NyxP83503 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NyxP83503 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NyxP83503 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NyxP83503 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NyxP83503 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NyxP83503 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NyxP83503 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NyxP83503 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NyxP83503 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NyxP83503 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NyxP83503 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NyxP83503 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NyxP83503 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NyxP83503 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NyxP83503 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NyxP83503 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NyxP83503 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NyxP83503 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NyxP83503 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms