Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx1P81068 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx1P81068 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx1P81068 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx1P81068 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx1P81068 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx1P81068 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx1P81068 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx1P81068 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx1P81068 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx1P81068 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx1P81068 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx1P81068 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms