Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CiitaP79621 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CiitaP79621 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CiitaP79621 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CiitaP79621 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CiitaP79621 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CiitaP79621 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CiitaP79621 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CiitaP79621 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CiitaP79621 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms