Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q6P79568 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q6P79568 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q6P79568 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Q6P79568 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q6P79568 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms