Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprvP70289 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprvP70289 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprvP70289 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PtprvP70289 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprvP70289 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprvP70289 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprvP70289 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprvP70289 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprvP70289 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprvP70289 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprvP70289 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprvP70289 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprvP70289 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprvP70289 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprvP70289 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprvP70289 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprvP70289 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprvP70289 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprvP70289 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprvP70289 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprvP70289 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprvP70289 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms