Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcsk1P63239 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk1P63239 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1P63239 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1P63239 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcsk1P63239 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms