Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpcal1P62748 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpcal1P62748 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpcal1P62748 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpcal1P62748 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpcal1P62748 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpcal1P62748 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hpcal1P62748 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hpcal1P62748 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hpcal1P62748 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hpcal1P62748 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms