Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap1s1P61967 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap1s1P61967 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap1s1P61967 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1s1P61967 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1s1P61967 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap1s1P61967 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms