Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf13P61216 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf13P61216 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf13P61216 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Taf13P61216 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf13P61216 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf13P61216 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf13P61216 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms