Protein–RNA interactions for Protein: P59900

Emilin3, EMILIN-3, mousemouse

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emilin3P59900 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Emilin3P59900 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emilin3P59900 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emilin3P59900 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Emilin3P59900 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emilin3P59900 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms