Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CgnP59242 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CgnP59242 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CgnP59242 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CgnP59242 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CgnP59242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CgnP59242 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CgnP59242 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CgnP59242 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CgnP59242 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CgnP59242 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CgnP59242 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CgnP59242 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CgnP59242 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CgnP59242 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CgnP59242 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CgnP59242 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CgnP59242 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CgnP59242 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CgnP59242 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CgnP59242 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CgnP59242 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CgnP59242 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CgnP59242 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CgnP59242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CgnP59242 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CgnP59242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CgnP59242 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CgnP59242 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CgnP59242 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CgnP59242 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CgnP59242 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CgnP59242 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CgnP59242 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CgnP59242 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CgnP59242 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CgnP59242 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CgnP59242 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CgnP59242 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CgnP59242 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CgnP59242 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CgnP59242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CgnP59242 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CgnP59242 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CgnP59242 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CgnP59242 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CgnP59242 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CgnP59242 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CgnP59242 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CgnP59242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CgnP59242 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CgnP59242 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CgnP59242 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CgnP59242 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CgnP59242 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CgnP59242 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CgnP59242 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CgnP59242 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CgnP59242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CgnP59242 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CgnP59242 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CgnP59242 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CgnP59242 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CgnP59242 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CgnP59242 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CgnP59242 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CgnP59242 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CgnP59242 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CgnP59242 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CgnP59242 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CgnP59242 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CgnP59242 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CgnP59242 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CgnP59242 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CgnP59242 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CgnP59242 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CgnP59242 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CgnP59242 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CgnP59242 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CgnP59242 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CgnP59242 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CgnP59242 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CgnP59242 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CgnP59242 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms