Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd4P58467 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd4P58467 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setd4P58467 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd4P58467 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd4P58467 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd4P58467 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Setd4P58467 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setd4P58467 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setd4P58467 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setd4P58467 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms