Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gsc2P56916 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gsc2P56916 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gsc2P56916 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms