Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc12a1P55014 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc12a1P55014 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc12a1P55014 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc12a1P55014 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms