Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CnbpP53996 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CnbpP53996 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CnbpP53996 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CnbpP53996 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CnbpP53996 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CnbpP53996 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CnbpP53996 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CnbpP53996 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CnbpP53996 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CnbpP53996 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CnbpP53996 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CnbpP53996 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CnbpP53996 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CnbpP53996 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CnbpP53996 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CnbpP53996 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CnbpP53996 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CnbpP53996 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CnbpP53996 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CnbpP53996 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CnbpP53996 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CnbpP53996 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CnbpP53996 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CnbpP53996 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CnbpP53996 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CnbpP53996 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CnbpP53996 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CnbpP53996 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CnbpP53996 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CnbpP53996 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CnbpP53996 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CnbpP53996 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CnbpP53996 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CnbpP53996 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms