Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Map3k1P53349 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Map3k1P53349 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Map3k1P53349 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Map3k1P53349 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Map3k1P53349 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Map3k1P53349 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Map3k1P53349 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Map3k1P53349 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.38■■■■□ 3.42
Map3k1P53349 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Map3k1P53349 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Map3k1P53349 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms