Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prox1P48437 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prox1P48437 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prox1P48437 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prox1P48437 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prox1P48437 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prox1P48437 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prox1P48437 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prox1P48437 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prox1P48437 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prox1P48437 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prox1P48437 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prox1P48437 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prox1P48437 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prox1P48437 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prox1P48437 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prox1P48437 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prox1P48437 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prox1P48437 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prox1P48437 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prox1P48437 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prox1P48437 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prox1P48437 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms