Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbx2P48031 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbx2P48031 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms