Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Pola1P33609 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pola1P33609 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pola1P33609 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pola1P33609 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pola1P33609 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Pola1P33609 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Pola1P33609 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pola1P33609 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pola1P33609 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Pola1P33609 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pola1P33609 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pola1P33609 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pola1P33609 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Pola1P33609 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pola1P33609 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pola1P33609 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pola1P33609 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms