Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd1P33215 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd1P33215 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd1P33215 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd1P33215 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms