Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa2P31245 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa2P31245 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa2P31245 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms