Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnd1P30999 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctnnd1P30999 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnnd1P30999 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms