Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dusp1P28563 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dusp1P28563 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Dusp1P28563 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms