Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd12P23812 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd12P23812 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd12P23812 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd12P23812 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd12P23812 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms