Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde6bP23440 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6bP23440 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6bP23440 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6bP23440 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms