Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HmbsP22907 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmbsP22907 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmbsP22907 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmbsP22907 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmbsP22907 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HmbsP22907 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmbsP22907 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmbsP22907 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmbsP22907 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HmbsP22907 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmbsP22907 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HmbsP22907 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmbsP22907 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmbsP22907 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HmbsP22907 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms