Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcaP20444 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkcaP20444 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkcaP20444 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms