Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lsp1P19973 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lsp1P19973 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsp1P19973 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lsp1P19973 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsp1P19973 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198 ms