Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifrd1P19182 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifrd1P19182 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifrd1P19182 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifrd1P19182 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifrd1P19182 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms