Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx1P13297 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx1P13297 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx1P13297 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msx1P13297 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx1P13297 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx1P13297 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx1P13297 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx1P13297 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msx1P13297 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msx1P13297 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Msx1P13297 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msx1P13297 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msx1P13297 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msx1P13297 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Msx1P13297 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx1P13297 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx1P13297 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx1P13297 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx1P13297 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msx1P13297 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx1P13297 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx1P13297 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx1P13297 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx1P13297 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx1P13297 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msx1P13297 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Msx1P13297 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx1P13297 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msx1P13297 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx1P13297 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msx1P13297 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx1P13297 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msx1P13297 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms