Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl2P10148 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl2P10148 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl2P10148 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms