Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-AaP01910 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-AaP01910 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-AaP01910 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-AaP01910 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-AaP01910 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-AaP01910 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-AaP01910 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2-AaP01910 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-AaP01910 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-AaP01910 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-AaP01910 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-AaP01910 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-AaP01910 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-AaP01910 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-AaP01910 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-AaP01910 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms