Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01788 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01788 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01788 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01788 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01788 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01788 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01788 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01788 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01788 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01788 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01788 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01788 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01788 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01788 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01788 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01788 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01788 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01788 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01788 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01788 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01788 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01788 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01788 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01788 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01788 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01788 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01788 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01788 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01788 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01788 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01788 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01788 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01788 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01788 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01788 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01788 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01788 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01788 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01788 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01788 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01788 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01788 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01788 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01788 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01788 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01788 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01788 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01788 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01788 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01788 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01788 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01788 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01788 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01788 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01788 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01788 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01788 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01788 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01788 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01788 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01788 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01788 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01788 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01788 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01788 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01788 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01788 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01788 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01788 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01788 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01788 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01788 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01788 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01788 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01788 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01788 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms