Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff1O88573 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Aff1O88573 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff1O88573 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff1O88573 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff1O88573 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff1O88573 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aff1O88573 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff1O88573 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff1O88573 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff1O88573 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff1O88573 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff1O88573 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff1O88573 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff1O88573 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aff1O88573 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Aff1O88573 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms