Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan6O70401 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan6O70401 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan6O70401 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tspan6O70401 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms