Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RngttO55236 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RngttO55236 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RngttO55236 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RngttO55236 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RngttO55236 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RngttO55236 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RngttO55236 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RngttO55236 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RngttO55236 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RngttO55236 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RngttO55236 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RngttO55236 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RngttO55236 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RngttO55236 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RngttO55236 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RngttO55236 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RngttO55236 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RngttO55236 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RngttO55236 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RngttO55236 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RngttO55236 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RngttO55236 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RngttO55236 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RngttO55236 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RngttO55236 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RngttO55236 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RngttO55236 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RngttO55236 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RngttO55236 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RngttO55236 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RngttO55236 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RngttO55236 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RngttO55236 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RngttO55236 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RngttO55236 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RngttO55236 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RngttO55236 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RngttO55236 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RngttO55236 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RngttO55236 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RngttO55236 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RngttO55236 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RngttO55236 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RngttO55236 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RngttO55236 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RngttO55236 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RngttO55236 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RngttO55236 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RngttO55236 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RngttO55236 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RngttO55236 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RngttO55236 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RngttO55236 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RngttO55236 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RngttO55236 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RngttO55236 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RngttO55236 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RngttO55236 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RngttO55236 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RngttO55236 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RngttO55236 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RngttO55236 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RngttO55236 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RngttO55236 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RngttO55236 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RngttO55236 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RngttO55236 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RngttO55236 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RngttO55236 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RngttO55236 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RngttO55236 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RngttO55236 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RngttO55236 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RngttO55236 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RngttO55236 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RngttO55236 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RngttO55236 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RngttO55236 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RngttO55236 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RngttO55236 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RngttO55236 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RngttO55236 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RngttO55236 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RngttO55236 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RngttO55236 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RngttO55236 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RngttO55236 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RngttO55236 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RngttO55236 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RngttO55236 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms