Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja1O55176 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja1O55176 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pja1O55176 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja1O55176 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja1O55176 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja1O55176 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja1O55176 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pja1O55176 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja1O55176 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms