Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg2O55111 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg2O55111 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg2O55111 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg2O55111 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms