Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Banf1O54962 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Banf1O54962 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Banf1O54962 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Banf1O54962 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Banf1O54962 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Banf1O54962 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Banf1O54962 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms