Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk2a2O54833 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk2a2O54833 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a2O54833 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk2a2O54833 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.8 ms