Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6aO35464 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6aO35464 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema6aO35464 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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