Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-ObO35424 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-ObO35424 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-ObO35424 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-ObO35424 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms