Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna6O35345 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kpna6O35345 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kpna6O35345 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kpna6O35345 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kpna6O35345 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kpna6O35345 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms