Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna3O35344 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna3O35344 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna3O35344 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms