Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srsf5O35326 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srsf5O35326 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Srsf5O35326 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srsf5O35326 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms