Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyth3O08967 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyth3O08967 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyth3O08967 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyth3O08967 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyth3O08967 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms