Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Barx2O08686 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Barx2O08686 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Barx2O08686 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Barx2O08686 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Barx2O08686 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Barx2O08686 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Barx2O08686 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Barx2O08686 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Barx2O08686 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Barx2O08686 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Barx2O08686 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Barx2O08686 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Barx2O08686 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230 ms