Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn2r78K7N6U5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn2r78K7N6U5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn2r78K7N6U5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn2r78K7N6U5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn2r78K7N6U5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn2r78K7N6U5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn2r78K7N6U5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn2r78K7N6U5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn2r78K7N6U5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn2r78K7N6U5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn2r78K7N6U5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn2r78K7N6U5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn2r78K7N6U5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn2r78K7N6U5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn2r78K7N6U5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn2r78K7N6U5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms